384 CPUs de treball, 12 CPUs de login, 3 Terabytes de RAM i 1 Petabyte (1000 Tb) dedicats a emmagatzematge; més o menys l’equivalent a 50 ordinadors domèstics, cadascun amb 20 discos durs, treballant a la vegada i connectats a una xarxa híper ràpida de 100 Gigabytes per segon. Aquestes són les dades de vertigen del nou clúster de computació d’alt rendiment (HPC) que s’acaba d’instal·lar a l’Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras, al campus de Can Ruti.

El nou maquinari organitzarà i centralitzarà tota l’activitat bioinformàtica de l’institut, multiplicant la potència dels equips individuals utilitzats anteriorment i reduint elements de confusió, com ara l’ús d’entorns operatius i programari diferents. Així, el nou equipament ofereix un mateix entorn d’alt rendiment i un mateix conjunt d’eines avançades, que imprimiran un segell de màxima qualitat a tota la recerca computacional del centre.

Fran Contreras, tècnic de la Unitat de IT liderada per Marc Jubany, confirma que el nou equipament és una gran millora ja que “l’Institut no tenia un sistema propi de computació, i feia servir serveis externs del CSUC o el BSC-CNS”. Contreras, que ha treballat colze a colze amb el David Galligani i la Diana Gallardo en la instal·lació d’aquest equipament, afegeix que “si bé el nou maquinari no està a l’alçada dels grans serveis de supercomputació mencionats, pocs centres de recerca compten amb un clúster propi d’ús exclusiu”. La Unitat de IT actuarà com a administradora dels serveis d’HPC i s’encarregarà del manteniment i actualització constant dels equips.

Tot i ser un recurs compartit homogeni, s’ha tingut cura que sigui completament personalitzable i adaptable a cada necessitat, cosa que permet optimitzar recursos i treballar en paral·lel, és a dir, en diverses tasques a la vegada. Izar de Villasante, tècnic de la Unitat de Bioinformàtica, assegura que el clúster de HPC “servirà per a tot allò que impliqui un us intensiu de memòria RAM, així com estudis genòmics de big data, que treballen amb arxius de més de 10 Terabytes”.

Villasante coneix bé el sistema i, des de la Unitat de Bioinformàtica dirigida per la Dra. Angelika Merkel, assessoraran els grups de recerca sobre la millor forma d’accedir al clúster i treballar sobre les dades experimentals, que no paren de créixer degut a l’ús de les noves tecnologies de seqüenciació massiva. Aquestes, ofereixen un grau de precisió inigualable en l’estudi del càncer i permeten que la recerca obri la porta a noves aproximacions terapèutiques contra la leucèmia i d’altres processos oncològics.

En un temps en el que les anàlisis bioinformàtiques són imprescindibles per entendre què està passant en una cèl·lula cancerosa, el nou clúster de computació d’alt rendiment de l’Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras promet donar un impuls important a la recerca, en benefici dels pacients.